В соответствии с перспективным планом создания линии электропередачи «Сибирь – Казахстан – Урал – Центр» в 1982 году в Барнауле было основано Западно-Сибирское предприятие межсистемных электропередач (ЗапСибМЭС). Оно выполняло функции заказчика строительства линии электропередачи 1150 кВ «Экибастуз – Барнаул» с соответствующей подстанцией в городе. Первый в Сибири участок этой линии протяженностью 371 км был принят в эксплуатацию в 1988 году. В том же году началось сооружение участка «Барнаул – Итат» (448 км). В 1997 году были созданы Межсистемные электрические сети Сибири, а в 2002 году они преобразованы в филиал ПАО «ФСК ЕЭС» – Магистральные электрические сети (МЭС) Сибири.
МЭС Сибири работают на территории Сибирского федерального округа. В зону его обслуживания входят 12 субъектов Российской Федерации с населением 19,3 млн человек.
МЭС Сибири отвечают за бесперебойную работу 460 линий электропередачи общей протяженностью по трассе 24 395,51 км и 124 подстанций общей трансформаторной мощностью 49 025,9 МВА. Филиал обеспечивает межгосударственные перетоки электроэнергии в Казахстан и Монголию.
В подчинении находятся 5 предприятий магистральных электросетей (ПМЭС) – Красноярское, Западно-Сибирское, Хакасское, Забайкальское и Кузбасское.
